A magyar helyi rádiós társadalom a kezdeti nehézségek, lassan kialakuló struktúrák és az 1996 előtti, még kialakulatlan jogi szabályozás időszakában korán megkezdte érdekvédelmi szervezetének létrehozását. 1995-re kialakult egy állandó egyeztető fórum, melynek résztvevői kezdetben csak informálisan ugyan, de rendszeresen egyeztették álláspontjaikat frekvencia-ügyekben, reklámpiaci stratégiákban, ill. szakmai kérdésekben. A testületileg történő fellépés igénye azért fogalmazódott meg, mert akkoriban már javában folyt a médiatörvény előkészítése, ugyanakkor a több mint félszáz helyi rádió még javaslattételi lehetőséget sem tudott kiharcolni magának a törvényalkotási folyamat során. A szervezetet végül is 1996 május 13-án, a médiatörvény megszületése után jegyezték be. Az egyesület alapszabálya szerint magát önkormányzati elven működő, szakmai érdekvédelmi és érdekképviseleti társadalmi szervezetként definiálta. Céljai megvalósítása érdekében az alábbi legfontosabb feladatokat tűzte maga elé: jogszabályok megalkotásának és intézkedések megtételének kezdeményezése, a helyi rádiókat érintő jogszabályok előkészítése során szakmai vélemény és javaslatok megfogalmazása, Felmerült még a Jogszabályok végrehajtásában való közreműködés, a helyi rádiókat érintő közös feladatok szervezése (pl. szakmai továbbképzés, közvélemény-kutatás készítése, műszaki fejlesztés, szerzői jogi kérdések, hírszolgáltatással kapcsolatos állásfoglalások, közös reklámszervezés stb.).

Távlati célként a HEROE regionális és nemzetközi együttműködések megkötésének igényét is megfogalmazta. A szervezet finanszírozása nagyrészt a befolyt tagdíjakból történt, ami kezdetben évi 20 ezer forint volt. Az egyesület első elnöke Szombathy Zoltán, az egykori kecskeméti Róna Rádió főszerkesztője volt, 1997 végén a közgyűlés Mészáros Zoltánt, a veszprémi JAM Rádió tulajdonosát bízta meg az ügyvezetői elnöki teendőkkel. Az új elnökség rendkívül részletes, jól kidolgozott szakmai javaslatot tett Ie az akkor már megalakult ORTT asztalára, és számos fontos megállapodást kötött. Az ORTT-nek tett javaslatok tartalmazták a műsorszolgáltatási díj elemeire vonatkozó pontrendszer véleményezésének lehetőségét. Ez volt az első alkalom, hogy az egyesület bizonyos javaslatait beépítették a későbbi jogszabályba. 1999. február 16-án az egyesület, a MÚOSZ Andrássy úti székházában megtartott közgyűlése nagy többséggel elnöknek választotta Mészáros Zoltánt, aki 2002-ig vezette a szervezetet. Őt Dr. Szombati Béla, a debreceni Rádió FM95 ügyvezetője (2001-2006), és Radetzky András, a Fehérvár Rádió vezetője (2006-2012) követte. 2010-ben egy évig Égető Gyula, a hódmezővásárhelyi Rádió 7 tulajdonos-vezetője állt a szervezet élén. A HEROE sorrendben 6. elnöke Dr. Szilvay Balázs lett, aki a szigetszentmiklósi Lakihegy Rádió vezetője. 2016-ban a közgyűlés ismét Radetzky András bízta meg az elnöki teendőkkel.

2020 óta a HEROE elnöke Ürge Dezső, a Sláger FM vezérigazgatója. A helyi rádiók megerősödésével a HEROE is egyre aktívabbá vált. Javaslatai rendszerint ma is ott vannak a döntéshozó szervezetek, hatóságok asztalán, ugyanakkor egyre nagyobb hangsúlyt fektet a rádiók reklámpiaci szerepének erősítésére, pozícióinak javítására is.